RVŠ si vytvorila stále odborné komisie. Niektoré stále komisie sa z historických dôvodov volajú Rady: Rada pre rozvoj a financovanie (RRF), Rada pre vedu, techniku a umenie (RVTU) a Rada pre vzdelávanie a výchovu (RVV). Veľmi dôležitou pri práci RVŠ je aj Legislatívna komisia (LK).